Geleceğin örnek, demokratik ve Atatürkçü düşünce ve felsefeyi taşıyan, doğaya ve kültürel değerlere sahip çıkan, teknolojinin yararlarından faydalanabilen, bilgi üretebilen, ilgi ve yeteneklerinin farkında, laik nesillerini hayata hazırlamak ve eğitim anlayışını sürekli iyileştirmek amacıyla, tercih edilen bir eğitim kurumu olarak faaliyet göstermektedir. Benimsenen eğitim anlayışı ve modeli gereği, öğrencilerin bilişsel gelişimlerinin en üst düzeyde olmasını sağlayarak, okuma, yazma, problem çözme gibi yeteneklerinin geliştirilmesi ve bu tarz çalışmalara katılmaları sağlanmaktadır. Bunun niçin Başkent Paylaşmaya Değer Fikirler Etkinliği düzenlenmektedir. Bu aktiviteler sayesinde öğrencilerin analitik düşünme ve farklı bakış açıları geliştirmelerine olanak sağlanmış olur. Başkent Üniversitesi Özel Başkent Fen Lisesi, alanında uzman öğretmenlerce, ders programını ve içeriğini öğrencilerin ihtiyaçlarına, ilgi ve yeteneklerine, öğrenme stillerine göre şekillendirmeleri gerektiği düşüncesi ile hareket etmektedir. Onların dinamik ve işbirliği içinde keşfetmelerini ve böylelikle öğrencilerin öğrenme sürecinin daimi ve kalıcı olarak devam etmesini sağlamaktadır. öğrencilerin böylelikle neyi bilip neyi bilmediklerinin farkında olarak yetişmelerini hedeflemektedir.