Özel Güzelbahçe Doğa Koleji Ortaokulu, öğrencilerini geniş yelpazede fiziksel imkanlara sahip kampüsüyle eğitim vermektedir. Kurumda sanat sokağı, dijital kütüphane, mucitler atölyesi, kulüp odaları, bilim odaları ve fen ve bilgisayar laboratuvarları bulunmaktadır. Okulda bunların yanı sıra açık ve kapalı spor alanları, müzik, bateri ve satranç odaları, konferans salonları, kütüphane ve okuma salonları, ekoloji dersliği ve çoklu zeka atölyesi de bulunmaktadır. Kurum, yeşil alanlara sahip kampüsüyle öğrencilerini kapalı alanlara sıkışmaktan kurtarmaktadır. Böylece öğrencilerin doğayla iç içe bir eğitim hayatı yaşaması sağlanmaktadır. Okul, bu alanlar sayesinde çeşitli sosyal aktiviteler düzenleyerek öğrencilerin karakter gelişimlerini desteklemektedir. Gezi kulübü, tiyatro ve sinema aktiviteleriyle öğrencilerin sanatsal yönleri açığa çıkarılarak entelektüel birikimleri beslenmektedir. Beden eğitimi, atletizm, masa tenisi, futbol ve voleybol aktiviteleri ise öğrencilerin fiziksel gelişimlerini maksimum seviyeye çıkarmayı amaçlamaktadır. Özel Güzelbahçe Doğa Koleji Ortaokulu, sanatsal ve sportif faaliyetlerin yanı sıra akıl ve zeka oyunları ve satranç aktiviteleri düzenlenmektedir. Bu aktivitelerle öğrencilerin zihinsel gelişimleri desteklenmekte ve öğrenme süreçleri hızlandırılmaktadır. Robotik ve kodlama ve bilişim kulübü aktiviteleriyle de öğrencilerin teknolojiyle iç içe bir eğitim almaları hedeflenmektedir. Bu aktivitelerle öğrenciler, çağın teknolojilerini sadece tüketen değil aynı zamanda üreten ve yöneten bireyler haline getirilmektedir. Ortaokul, öğrenciler liseye geçiş sınavına hazırlandıkları için kritik bir dönem olmaktadır. Kurumda bu sebeple eğitimciler, alanında uzman öğretmenler arasından özenle geçmektedir. Öğretmenler, öğrencilere yönelik kapsamlı bir eğitim programı uygularken okulun rehberlik servisi destekleyici çalışmalar yürütmektedir. Rehberlik servisi, öğrencilerin akademik ilerlemelerini takip altına alarak eksik oldukları konuları belirlemektedir. Öğretmenler bu sayede öğrencilerin ihtiyacı oldukları konularda nokta atışı destek verebilmektedir. Okulun psikolojik danışmanı da bu süreçte önemli bir rol oynamaktadır. Öğrencilerle düzenli olarak görüşen danışman, yaşanabilecek psikolojik problemlere karşı önlemler almaktadır.